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Mensajes - Coordinación Observation España

#31
Cuando das de alta una observación puedes elegir de qué manera has contado el número de individuos:


       
  • Sin especificar (Por defecto)
  • Conteo preciso: Has contado exactamente el número de individuos que había
  • Conteo aproximado: Has contado de manera aproximada el número total de individuos.
  • Extrapolación: Has contado parcialmente el número de individuos, y has extrapolado para llegar a la cifra total.
  • Visto/Sin contar: Has visto la especie pero no has contado el número de individuos. Introduce un 1 en número de individuos
  • Abundancia: Has visto la especie, no has contado el número de individuos pero era muy abundante. Introduce 1 en número de individuos.

#32
Cita de: saulrr97 en Febrero 24, 2021, 10:31:47 PM
Las siguientes especies están clasificadas como nativas.

Especie exótica invasora: Cangrejo rojo americano
https://observation.org/species/10083/

Especie exótica invasora y clasificada como rareza: Cangrejo señal
https://observation.org/species/20581/

Especie exótica invasora: Mimosa
https://observation.org/species/113751/

Especie exótica invasora: Visón americano
https://observation.org/species/18418/

Especie exótica invasora: Gálapago de Florida
https://observation.org/species/79350/

El estatus se establece a nivel regional. Es decir, que a nivel internacional siempre son nativas. Debes mirarlo en este caso en el portal de España:

Estas ya estaban correctas:
https://spain.observation.org/soort/info/10083
https://spain.observation.org/soort/info/20581
https://spain.observation.org/soort/info/18418
https://spain.observation.org/soort/info/79350

Esta se ha marcado como "Naturalizada":
https://spain.observation.org/soort/info/113751
#33
Bugs en Observation.org / Re:Bugs corregidos
Febrero 09, 2021, 05:11:23 PM

Se han corregido varios bugs del sitio nuevo y/o viejo:

       
  • La exportación a CSV vuelve a funcionar
  • Mapas de presencia: Al pulsar en cuadrícula se mostraban todas las especies
  • Fotos: Corregida la tabla de datos
  • Localizaciones personales: Ya se pueden crear en el sitio nuevo sin error
  • Ordenar listados por número de observaciones
  • Fotos: Fecha no era clickable a veces
#34
Bugs en Observation.org / Bugs corregidos
Febrero 09, 2021, 05:10:22 PM
En este hilo se muestran los errores corregidos a día de hoy.

Este listado se actualiza desde el foro holandés (https://forum.waarneming.nl/)
#35
Aves / Añadida Carina moschata domestica
Febrero 05, 2021, 09:13:43 AM
Cairina moschata es una especie nativa de la América Tropical que se ha extendido por todo el mundo al ser domesticada. La forma doméstica se encuentra en estado semisalvaje por todo el mundo, aunque su habitat natural actual abarca desde México hasta el centro de Argentina y Uruguay, en zonas de clima tropical y subtropical y entre altitudes que van desde el nivel del mar hasta los 1000 m s. n. m.. (más en Wikipedia)

Es por esto que hemos añadido esta forma domestica, y hemos modificado todas las observaciones fuera de su habitat natural.

https://spain.observation.org/soort/maps/1015687?from=2020-02-05&to=2021-02-05
#36
Coordinador nacional
Julio Rabadán González

Administración Observado.es
Pablo Antonio Álvarez Valdés (Asturias)
Juan I. Deán (Navarra)
Jason Moss (Baleares)
Javier Rengel
Cosme Damián Romay (Galicia, Cantabria, Euskadi*, Cataluña*)
Jose Antonio Sarrión (Andalucía, Canarias)
Rafael Vicente (Castilla y León)
SEZ (Extremadura)
- (Euskadi)
- (Madrid)
- (Cataluña)
- (Castilla La Mancha)
- (Aragón)
- (Comunidad Valenciana)
- (Murcia)

*Provisional

Responsable de Ciencia Ciudadana
Antonio Canepa

Apoyo GIS
Guillermo Castel Sánchez

Gestión de grupos taxonómicos

Aves
Jose Antonio Sarrión
Jorge Valella

Mamíferos
SECEM

Reptiles y anfibios
Eduardo José Rodríguez Rodríguez

Hongos
Luis García Bona

Grupos aún sin responsable específico asignado
Plantas
Algas
Musgos y líquenes
Mariposas
Polillas
Libélulas
Insectos (otros)
Moluscos
Peces
Hemípteros
Ortópteros
Escarabajos
Himenópteros
Dípteros
Otros artrópodos
Otros invertebrados





#37
¿Cómo descargar los datos?
¿Cómo trabajar con los datos de observaciones que podemos obtener en bruto de la web Observation.org (Observado en España), para procesarlos después con R utilizando una base de datos como intermediario? En colaboración con la Universidad de Burgos hemos realizado un cursillo sobre el manejo de datos de Ciencia Ciudadana, que podéis ver en nuestro canal de YouTube: https://www.youtube.com/watch?v=zlAeO8PpKhk&list=PLBulBnVr1-h4V-pL-PAysl-gjOlYINx8M

En este pequeño artículo os vamos a explicar una primera parte del curso que tenéis en vídeo, en el que veremos la estructura de la información que nos descargamos de Observation.org.

En este artículo vamos a ver el formato del sitio antiguo de Observation.org o, lo que es lo mismo, en spain.observation.org y cualquiera de los portales regionales.

Si lo que queremos es trabajar con nuestras propias observaciones, podemos ir al menú "Mi observation.org > Exportar/backup" . Seleccionamos los filtros que queramos aplicar para la descarga, como el grupo de especies, nivel de rareza, o un rango de fechas.

Es importante que marquemos la opción "Archivo CSV", que nos dará el máximo de información.

Formulario de descarga de observaciones propias





Una vez pulsemos el botón "Actualizar" se mostrará justo debajo del botón el enlace que deberemos seguir para descargar la información.



Si lo que queremos es obtener observaciones de todos los usuarios de Observation.org enviaremos un correo a info@observation.org con el detalle de la información que queremos descargar, y nos enviarán el paquete de datos directamente.

¿Qué formato tienen los datos?

Como resultado de ambas operaciones obtendremos un CSV muy similar, con todos los detalles de cada una de las observaciones.

Estos ficheros CSV descargados están en formato UTF-16, idioma español, y con los valores separados por tabuladores. Se pueden abrir de manera directa con LibreOffice o MS Excel, aunque es recomendable usar LibreOffice porque maneja mejor los ficheros CSV que MS Excel.

En la tabla siguiente podemos consultar las columnas presentes en el CSV que se descarga al consultar las observaciones personales desde el portal Observation.org, y qué información se incluye en cada una de ellas:
NombreValores
Id  Identificador único de la observación (principal)
scientific name  Nombre científico de la especie observada
species name    Nombre común en el idioma seleccionado
family  Familia taxonómica
species type  Tipo de taxón: especie, subespecie, forma, multiespecie, etc.
species group   Grupo de especies al que pertenece el taxón observado
date  Fecha de la observación
timeHora de la observación
created    Fecha de envío de la observación
modified Fecha de última modificación de la observación
source  Orígen de la observación: ObsMapp, iObs, Sitio Web, copiada de otro observador, importada de eBird, etc.
number  Número de individuos observados
sexo  Valor seleccionado.
"U" -> Sin especificar
"F" -> Hembra
"M" -> Macho
counting method  Valor seleccionado
life stage  Estadío vital/Apariencia seleccionada
activityValor seleccionado
lonCoordenada decimal X (longitud) en datum WGS84, con precisión de 5 decimales
lat  Coordenada decimal Y (latitud) en datum WGS84, con precisión de 5 decimales
location  Nombre del polígono más pequeño existente donde se encuentra la observación, a fecha de creación de la observación
country divisionProvincia donde se encuentra la observación
country  País donde se encuentra la observación
is certain  ATENCIÓN: A percepción del observador, si tiene dudas en la identificación o no
Valores:
"true" si el observador está seguro de la observación
"false" si la marcó como "Con dudas"
is escape  "false" si es una observación un individuo silvestre
"true" si es una observación de un individuo cuya presencia no es natural, sino que hay intervención humana
link  URL a la observación
accuracyPrecisión en metros de la ubicación. 999 si no se conoce la precisión
validation  Estado de validación de la observación.
Valores:
"O" -> Observación sin evaluar por un experto
"A" -> Observación aprobada automáticamente en base al conocimiento previo
"J"-> Observación aprobada manualmente por un experto
"N" -> Observación marcada como incorrecta por un experto
"P" -> Observación aprobada por un experto, basada en conocimiento previo
"U" -> Observación con dudas y que no se puede validar apropiadamente
"I" -> Observación bajo estudio
has photos"true" si adjunta fotos. "false" en caso contrario
has sounds"true" si adjunta sonidos. "false" en caso contrario
related species  Especie secundaria de la observación
substrateValor introducido
method Método de observación
notes  Comentarios adicionales del observador
validator name  Nombre de la persona responsable de la valdiación de la observación
last validation date  Fecha de última revisión de la observación
obscurity  Si la observación está oculta por seguridad
obscurity  Si la observación está oculta por seguridad
embargo date  Fecha hasta la que la observcación está oculta
external reference  Enlace externo con información adicional
user name  Nombre de la persona autora de la observación
user id  Identificador de la cuenta de la persona autora de la observación


¿Cómo analizo los datos?
   
Podríamos empezar a trabajar con estos dicheros directamente en R, pero en esta serie de artículos vamos a explicar cómo manejar ficheros grandes, de varios cientos de megas, de manera óptima. En vez de introducir directamente los ficheros en R o filtrarlos con AWK, como hacen otras bibliotecas de manejo de datos, vamos a avanzar un paso más utilizando un motor de base de datos real, tal como se explica en el curso de análisis de Ciencia Ciudadana de Observation.orghttps://www.youtube.com/watch?v=zlAeO8PpKhk&list=PLBulBnVr1-h4V-pL-PAysl-gjOlYINx8M
#38
Cita de: Maeradefigar en Noviembre 26, 2020, 11:20:54 PM
Hola,
Sería interesante que se pudiesen ingresar también desde Obsmapp, además desde la web.
Un saludo.

Cita de: Coordinación Observado.es en Noviembre 21, 2020, 07:35:47 PM
Cita de: Maeradefigar en Noviembre 20, 2020, 01:49:08 PM
Hola.
Carnivora sale en la web, no así en la app, le ocurre lo mismo que ocurría con el Quercus orocantabrica

Lo de incluir arctiodactyla es porque a menudo hay rastros de especies de este orden que no se pueden asignar con certeza a una especie, pero sí al grupo. Por ejemplo de jabalí/ciervo. Hay que ir al orden  puesto que el suborden ya los subdivide en grupos distintos y tampoco encajarían en esta agrupación.

Artiodactyla indet.
https://observation.org/soort/info/974782
Ya existía en Observation.org. La he agregado a la lista de especies de España.

Carnivora indet. ya está agregado en la lista de especies de España

Alectoris rufa  / Perdix perdix
https://spain.observation.org/soort/view/1003732
Añadida a Observation.org y a la lista local de aves de España

Salud!

HECHO
#39
Cita de: ja_sarrion en Noviembre 24, 2020, 06:43:02 PM
Para añadir esta especie que se encuentra en la ciudad autónoma de melilla

Artrópodos (Otras familias))
Scorpio maurus
Escorpión dorado de israel
Linnaeus, 1758
Scorpionidae   
https://www.gbif.org/species/6894666

HECHO
#40
Aves / Re:Abubilla en mi jardín
Noviembre 22, 2020, 07:08:55 PM
Cita de: JIDEAN en Noviembre 22, 2020, 08:21:40 AM
Hola,
Te comento que en la ciudad de Pamplona las abubillas se han ido urbanizando y lo que antes parecía imposible, observar una abubilla en la ciudad, ahora es normal. También recuerdo haber visto en otros países abubillas en jardines relativamente urbanizados cuando aquí era una rareza de manera que lo que está pasando aquí igual no es tan inusual para la especie en términos generales. Y ciertamente son bastante constantes en los lugares que emplean para nidificar, cementerio, ciudadela, antigua cárcel, las murallas cerca de la catedral,... por lo que una caja nido podría hacer que se asentaran más fácilmente. Y luego como dice Julio depende de la naturaleza.
Saludos
Juan

Toda la razón, Juan I. Deán. Aquí en el sur es bastante común que la abubilla campee por la ciudad (no tanto la cría). En los datos de observaciones de Abubilla en el casco urbano de la ciudad de Sevilla,  hay bastantes citas, aunque casi todas en la periferia.

Saludos
#41
Cita de: Maeradefigar en Noviembre 20, 2020, 01:49:08 PM
Hola.
Carnivora sale en la web, no así en la app, le ocurre lo mismo que ocurría con el Quercus orocantabrica

Lo de incluir arctiodactyla es porque a menudo hay rastros de especies de este orden que no se pueden asignar con certeza a una especie, pero sí al grupo. Por ejemplo de jabalí/ciervo. Hay que ir al orden  puesto que el suborden ya los subdivide en grupos distintos y tampoco encajarían en esta agrupación.

Artiodactyla indet.
https://observation.org/soort/info/974782
Ya existía en Observation.org. La he agregado a la lista de especies de España.

Carnivora indet. ya está agregado en la lista de especies de España

Alectoris rufa  / Perdix perdix
https://spain.observation.org/soort/view/1003732
Añadida a Observation.org y a la lista local de aves de España

Salud!

#42
Aves / Re:Abubilla en mi jardín
Noviembre 21, 2020, 07:30:42 PM
Cita de: Juan Pérez en Noviembre 21, 2020, 10:49:37 AM
Hola

La pasada primavera tuvimos en nuestro jardín la visita de una abubilla frecuentemente. Nos extrañaba mucho verla a diario siempre rondando un olivo centenario que tenemos en dicho jardín hasta que fijandonos bien vimos que se metía en un hueco del tronco y pudimos comprobar que preparo un nido e incluso tuvo sus crias.

Yo en esto de la orinitología soy nuevo o novato pero a mi hijo le encanta y tengo una duda. Esta próxima primavera creeis que volverá al olivo? Y sería bueno que le pongamos una caja nido  como esta, para que en caso de que vuelva con ganas de criar de nuevo tenga un espacio más adecuado?

Un saludo y perdonar mi ignorancia

Juan

Buenas tardes, Juan.
Las abubillas, y en general todas las aves, eligen los lugares de cría con cierta exquisitez. Las abubillas suelen críar en los huecos de olivos de manera natural. Si el olivo de tu jardín lo ha escogido una pareja para criar, y les ha ido bien este año, es probable que repitan el año que viene. Ponerles una caja nido cerca puede ayudar si la caja ofrece mejores condiciones para la cría que el hueco del árbol, pero ya está en la naturaleza del pájaro que lo prefiera. ¡Puede que además les vaya mejor en el hueco que en la caja!

Enhorabuena por tener un jardín que sirve de hogar para una especie tan peculiar. Que la disfrutéis durante mucho tiempo.

Julio Rabadán
#43
Cita de: Maeradefigar en Noviembre 18, 2020, 10:31:39 PM
Hola, me gustaría solicitar la adición de las siguientes "especies":

Perdiz roja/Perdiz pardilla – Alectoris rufa/Perdix perdix

Carnívoro sin identificar – Carnivora indet.

Arctiodáctilo sin identificar – Arctiodactyla indet.

Roble orocantábrico - Quercus orocantabrica: está en la web, pero no en Obsmapp

Gracias de antemano.

Un saludo.

Buenas, Pablo.

A ser posible, cuando solicites una especie, aunque sea una multiespecie, indica grupo de especies, autor, familia, y el resto de parámetros. Así hacemos esto más ágil y evitas que, además de pasar la solicitud al foro holandés, tenga que detenerme solicitud a solicitud buscando esa información.

Te respondo especie a especie.

CitarPerdiz roja/Perdiz pardilla – Alectoris rufa/Perdix perdix
Solicitado

CitarCarnívoro sin identificar – Carnivora indet.
Ya existía
https://observation.org/species/927737/

CitarArctiodáctilo sin identificar – Arctiodactyla indet.
Esto es un orden parafilético, no está reconocido por GBIF y lo tenemos que dar de alta a mano. Debes saber que incluye los cetáceos.

CitarRoble orocantábrico - Quercus orocantabrica
No estaba incluido en la lista de plantas de España según la lista del Real Jardín Botánico de Madrid, a partir de la cual hemos creado el listado. Añadido queda.

¡Muchas gracias a ti!
Julio


#44
Aves / Cambios en la familia Sylviidae
Septiembre 22, 2020, 06:22:53 PM
Como bien sabéis, Observation.org se guía para aves por la lista patrón del IOC (http://www.worldbirdnames.org/new/). Recientemente se ha revisado la taxonomía de la familia Sylviidae, afectándonos en nuestro territorio los siguientes cambios:


       
  • Todas las especies del género Sylvia se cambian al género Curruca con excepción de Sylvia borin y Sylvia atricapilla
  • La especie Sylvia cantillans se divide en Curruca cantillans y Curruca iberiae, con distribución esta última en la península Ibérica y norte de África
Curruca iberiae corresponde a la especie presente y común en nuestro territorio, con nombre Curruca Carrasqueña Occidental o Ibérica.

Curruca cantillans (Curruca Carrasqueña Oriental) se considera por tanto rareza en España.

Queda por lo tanto así la tabla de sílvidos:







































Nombre común__Anterior nombre científico____Nuevo nombre científico__
Curruca Capirotada-Sylvia atricapilla-Sylvia atricapilla
Curruca Mosquitera-Sylvia borin-Sylvia borin
Curruca Balear-Sylvia balearica-Curruca balearica
Curruca Carrasqueña-Sylvia cantillans
->Curruca Carrasqueña Oriental-Curruca cantillans
->Curruca Carrasqueña Occidental-Curruca iberiae
Curruca Zarcera-Sylvia communis-Curruca communis
Curruca Tomillera-Sylvia conspicillata-Curruca conspicillata
Curruca Zarcerilla-Sylvia curruca-Curruca curruca
Curruca Sahariana-Sylvia deserti-Curruca deserti
Curruca del Atlas-Sylvia deserticola-Curruca deserticola
Curruca Mirlona-Sylvia hortensis-Curruca hortensis
Curruca Cabecinegra-Sylvia melanocephala-Curruca melanocephala
Curruca Enana-Sylvia nana-Curruca nana
Curruca Gavilana-Sylvia nisoria-Curruca nisoria
Curruca Sarda-Sylvia sarda-Curruca sarda
Curruca Subalpina-Sylvia subalpina-Curruca subalpina
Curruca Rabilarga-Sylvia undata-Curruca undata
#45
Cita de: ja_sarrion en Abril 19, 2020, 07:20:06 PM
Hola este area está mal, visto desde www.observation.org
https://observation.org/gebied/info/245321
sale en argelia.

Luego este área se corresponde al Parque rural de Betancuria: https://observation.org/gebied/info/606093 y hay que especificarlo.
Y ya para acabar no se encuentra la capa del municipio de betancuria.

En cuanto al municipio de La oliva, este area no tiene ningún tipo de sentido, ni pertenece a un espacio protegido, ni area de interés ni siquiera localidad, por lo que sería recomendable borrarla.https://observation.org/gebied/info/109287

He hecho estas modificaciones, excepto la capa del municipio de Betancuria, para la que haría falta el KML