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#51
Bugs en Observation.org / Re:Bugs corregidos
Último mensaje por Coordinación Observation España - Febrero 09, 2021, 05:11:23 PMSe han corregido varios bugs del sitio nuevo y/o viejo:
- La exportación a CSV vuelve a funcionar
- Mapas de presencia: Al pulsar en cuadrícula se mostraban todas las especies
- Fotos: Corregida la tabla de datos
- Localizaciones personales: Ya se pueden crear en el sitio nuevo sin error
- Ordenar listados por número de observaciones
- Fotos: Fecha no era clickable a veces
#52
Bugs en Observation.org / Bugs corregidos
Último mensaje por Coordinación Observation España - Febrero 09, 2021, 05:10:22 PMEn este hilo se muestran los errores corregidos a día de hoy.
Este listado se actualiza desde el foro holandés (https://forum.waarneming.nl/)
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#53
Aves / Añadida Carina moschata domest...
Último mensaje por Coordinación Observation España - Febrero 05, 2021, 09:13:43 AMCairina moschata es una especie nativa de la América Tropical que se ha extendido por todo el mundo al ser domesticada. La forma doméstica se encuentra en estado semisalvaje por todo el mundo, aunque su habitat natural actual abarca desde México hasta el centro de Argentina y Uruguay, en zonas de clima tropical y subtropical y entre altitudes que van desde el nivel del mar hasta los 1000 m s. n. m.. (más en Wikipedia)
Es por esto que hemos añadido esta forma domestica, y hemos modificado todas las observaciones fuera de su habitat natural.
https://spain.observation.org/soort/maps/1015687?from=2020-02-05&to=2021-02-05
Es por esto que hemos añadido esta forma domestica, y hemos modificado todas las observaciones fuera de su habitat natural.
https://spain.observation.org/soort/maps/1015687?from=2020-02-05&to=2021-02-05
#54
Información General sobre Observation.org / Re:Especies que faltan
Último mensaje por Maeradefigar - Febrero 01, 2021, 10:47:02 AMA raiz de observaciones que están teniendo lugar, quisiera solicitar la creación del híbrido de gavión atlántico (Larus marinus) x gavión hiperbóreo (Larus hyperboreus), el denominado "Fisterra Gull". No aparece en la lista de especies.
Gracias
Gracias
#55
Información General sobre Observation España / Equipo de Observation España
Último mensaje por Coordinación Observation España - Enero 29, 2021, 12:41:57 PMCoordinador nacional
Julio Rabadán González
Administración Observado.es
Pablo Antonio Álvarez Valdés (Asturias)
Juan I. Deán (Navarra)
Jason Moss (Baleares)
Javier Rengel
Cosme Damián Romay (Galicia, Cantabria, Euskadi*, Cataluña*)
Jose Antonio Sarrión (Andalucía, Canarias)
Rafael Vicente (Castilla y León)
SEZ (Extremadura)
- (Euskadi)
- (Madrid)
- (Cataluña)
- (Castilla La Mancha)
- (Aragón)
- (Comunidad Valenciana)
- (Murcia)
*Provisional
Responsable de Ciencia Ciudadana
Antonio Canepa
Apoyo GIS
Guillermo Castel Sánchez
Gestión de grupos taxonómicos
Aves
Jose Antonio Sarrión
Jorge Valella
Mamíferos
SECEM
Reptiles y anfibios
Eduardo José Rodríguez Rodríguez
Hongos
Luis García Bona
Grupos aún sin responsable específico asignado
Plantas
Algas
Musgos y líquenes
Mariposas
Polillas
Libélulas
Insectos (otros)
Moluscos
Peces
Hemípteros
Ortópteros
Escarabajos
Himenópteros
Dípteros
Otros artrópodos
Otros invertebrados
Julio Rabadán González
Administración Observado.es
Pablo Antonio Álvarez Valdés (Asturias)
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Javier Rengel
Cosme Damián Romay (Galicia, Cantabria, Euskadi*, Cataluña*)
Jose Antonio Sarrión (Andalucía, Canarias)
Rafael Vicente (Castilla y León)
SEZ (Extremadura)
- (Euskadi)
- (Madrid)
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- (Aragón)
- (Comunidad Valenciana)
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*Provisional
Responsable de Ciencia Ciudadana
Antonio Canepa
Apoyo GIS
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Gestión de grupos taxonómicos
Aves
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Mamíferos
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Reptiles y anfibios
Eduardo José Rodríguez Rodríguez
Hongos
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Grupos aún sin responsable específico asignado
Plantas
Algas
Musgos y líquenes
Mariposas
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Otros invertebrados
#56
Cómo usar Observation.org / Cómo utilizar los datos de Ob...
Último mensaje por Coordinación Observation España - Diciembre 21, 2020, 11:03:14 AM¿Cómo descargar los datos?
¿Cómo trabajar con los datos de observaciones que podemos obtener en bruto de la web Observation.org (Observation España), para procesarlos después con R utilizando una base de datos como intermediario? En colaboración con la Universidad de Burgos hemos realizado un cursillo sobre el manejo de datos de Ciencia Ciudadana, que podéis ver en nuestro canal de YouTube: https://www.youtube.com/watch?v=zlAeO8PpKhk&list=PLBulBnVr1-h4V-pL-PAysl-gjOlYINx8M
En este pequeño artículo os vamos a explicar una primera parte del curso que tenéis en vídeo, en el que veremos la estructura de la información que nos descargamos de Observation.org.
En este artículo vamos a ver el formato del sitio antiguo de Observation.org o, lo que es lo mismo, en spain.observation.org y cualquiera de los portales regionales.
Si lo que queremos es trabajar con nuestras propias observaciones, podemos ir al menú "Mi observation.org > Exportar/backup" . Seleccionamos los filtros que queramos aplicar para la descarga, como el grupo de especies, nivel de rareza, o un rango de fechas.
Es importante que marquemos la opción "Archivo CSV", que nos dará el máximo de información.
Formulario de descarga de observaciones propias
Una vez pulsemos el botón "Actualizar" se mostrará justo debajo del botón el enlace que deberemos seguir para descargar la información.
Si lo que queremos es obtener observaciones de todos los usuarios de Observation.org enviaremos un correo a info@observation.org con el detalle de la información que queremos descargar, y nos enviarán el paquete de datos directamente.
¿Qué formato tienen los datos?
Como resultado de ambas operaciones obtendremos un CSV muy similar, con todos los detalles de cada una de las observaciones.
Estos ficheros CSV descargados están en formato UTF-16, idioma español, y con los valores separados por tabuladores. Se pueden abrir de manera directa con LibreOffice o MS Excel, aunque es recomendable usar LibreOffice porque maneja mejor los ficheros CSV que MS Excel.
En la tabla siguiente podemos consultar las columnas presentes en el CSV que se descarga al consultar las observaciones personales desde el portal Observation.org, y qué información se incluye en cada una de ellas:
¿Cómo analizo los datos?
Podríamos empezar a trabajar con estos dicheros directamente en R, pero en esta serie de artículos vamos a explicar cómo manejar ficheros grandes, de varios cientos de megas, de manera óptima. En vez de introducir directamente los ficheros en R o filtrarlos con AWK, como hacen otras bibliotecas de manejo de datos, vamos a avanzar un paso más utilizando un motor de base de datos real, tal como se explica en el curso de análisis de Ciencia Ciudadana de Observation.org: https://www.youtube.com/watch?v=zlAeO8PpKhk&list=PLBulBnVr1-h4V-pL-PAysl-gjOlYINx8M
¿Cómo trabajar con los datos de observaciones que podemos obtener en bruto de la web Observation.org (Observation España), para procesarlos después con R utilizando una base de datos como intermediario? En colaboración con la Universidad de Burgos hemos realizado un cursillo sobre el manejo de datos de Ciencia Ciudadana, que podéis ver en nuestro canal de YouTube: https://www.youtube.com/watch?v=zlAeO8PpKhk&list=PLBulBnVr1-h4V-pL-PAysl-gjOlYINx8M
En este pequeño artículo os vamos a explicar una primera parte del curso que tenéis en vídeo, en el que veremos la estructura de la información que nos descargamos de Observation.org.
En este artículo vamos a ver el formato del sitio antiguo de Observation.org o, lo que es lo mismo, en spain.observation.org y cualquiera de los portales regionales.
Si lo que queremos es trabajar con nuestras propias observaciones, podemos ir al menú "Mi observation.org > Exportar/backup" . Seleccionamos los filtros que queramos aplicar para la descarga, como el grupo de especies, nivel de rareza, o un rango de fechas.
Es importante que marquemos la opción "Archivo CSV", que nos dará el máximo de información.
Formulario de descarga de observaciones propias
Una vez pulsemos el botón "Actualizar" se mostrará justo debajo del botón el enlace que deberemos seguir para descargar la información.
Si lo que queremos es obtener observaciones de todos los usuarios de Observation.org enviaremos un correo a info@observation.org con el detalle de la información que queremos descargar, y nos enviarán el paquete de datos directamente.
¿Qué formato tienen los datos?
Como resultado de ambas operaciones obtendremos un CSV muy similar, con todos los detalles de cada una de las observaciones.
Estos ficheros CSV descargados están en formato UTF-16, idioma español, y con los valores separados por tabuladores. Se pueden abrir de manera directa con LibreOffice o MS Excel, aunque es recomendable usar LibreOffice porque maneja mejor los ficheros CSV que MS Excel.
En la tabla siguiente podemos consultar las columnas presentes en el CSV que se descarga al consultar las observaciones personales desde el portal Observation.org, y qué información se incluye en cada una de ellas:
| Nombre | Valores |
| Id | Identificador único de la observación (principal) |
| scientific name | Nombre científico de la especie observada |
| species name | Nombre común en el idioma seleccionado |
| family | Familia taxonómica |
| species type | Tipo de taxón: especie, subespecie, forma, multiespecie, etc. |
| species group | Grupo de especies al que pertenece el taxón observado |
| date | Fecha de la observación |
| time | Hora de la observación |
| created | Fecha de envío de la observación |
| modified | Fecha de última modificación de la observación |
| source | Orígen de la observación: ObsMapp, iObs, Sitio Web, copiada de otro observador, importada de eBird, etc. |
| number | Número de individuos observados |
| sexo | Valor seleccionado. "U" -> Sin especificar "F" -> Hembra "M" -> Macho |
| counting method | Valor seleccionado |
| life stage | Estadío vital/Apariencia seleccionada |
| activity | Valor seleccionado |
| lon | Coordenada decimal X (longitud) en datum WGS84, con precisión de 5 decimales |
| lat | Coordenada decimal Y (latitud) en datum WGS84, con precisión de 5 decimales |
| location | Nombre del polígono más pequeño existente donde se encuentra la observación, a fecha de creación de la observación |
| country division | Provincia donde se encuentra la observación |
| country | País donde se encuentra la observación |
| is certain | ATENCIÓN: A percepción del observador, si tiene dudas en la identificación o no Valores: "true" si el observador está seguro de la observación "false" si la marcó como "Con dudas" |
| is escape | "false" si es una observación un individuo silvestre "true" si es una observación de un individuo cuya presencia no es natural, sino que hay intervención humana |
| link | URL a la observación |
| accuracy | Precisión en metros de la ubicación. 999 si no se conoce la precisión |
| validation | Estado de validación de la observación. Valores: "O" -> Observación sin evaluar por un experto "A" -> Observación aprobada automáticamente en base al conocimiento previo "J"-> Observación aprobada manualmente por un experto "N" -> Observación marcada como incorrecta por un experto "P" -> Observación aprobada por un experto, basada en conocimiento previo "U" -> Observación con dudas y que no se puede validar apropiadamente "I" -> Observación bajo estudio |
| has photos | "true" si adjunta fotos. "false" en caso contrario |
| has sounds | "true" si adjunta sonidos. "false" en caso contrario |
| related species | Especie secundaria de la observación |
| substrate | Valor introducido |
| method | Método de observación |
| notes | Comentarios adicionales del observador |
| validator name | Nombre de la persona responsable de la valdiación de la observación |
| last validation date | Fecha de última revisión de la observación |
| obscurity | Si la observación está oculta por seguridad |
| obscurity | Si la observación está oculta por seguridad |
| embargo date | Fecha hasta la que la observcación está oculta |
| external reference | Enlace externo con información adicional |
| user name | Nombre de la persona autora de la observación |
| user id | Identificador de la cuenta de la persona autora de la observación |
¿Cómo analizo los datos?
Podríamos empezar a trabajar con estos dicheros directamente en R, pero en esta serie de artículos vamos a explicar cómo manejar ficheros grandes, de varios cientos de megas, de manera óptima. En vez de introducir directamente los ficheros en R o filtrarlos con AWK, como hacen otras bibliotecas de manejo de datos, vamos a avanzar un paso más utilizando un motor de base de datos real, tal como se explica en el curso de análisis de Ciencia Ciudadana de Observation.org: https://www.youtube.com/watch?v=zlAeO8PpKhk&list=PLBulBnVr1-h4V-pL-PAysl-gjOlYINx8M
#57
Información General sobre Observation.org / Re:Especies que faltan
Último mensaje por Coordinación Observation España - Noviembre 27, 2020, 08:37:53 AMCita de: Maeradefigar en Noviembre 26, 2020, 11:20:54 PM
Hola,
Sería interesante que se pudiesen ingresar también desde Obsmapp, además desde la web.
Un saludo.Cita de: Coordinación Observado.es en Noviembre 21, 2020, 07:35:47 PMCita de: Maeradefigar en Noviembre 20, 2020, 01:49:08 PM
Hola.
Carnivora sale en la web, no así en la app, le ocurre lo mismo que ocurría con el Quercus orocantabrica
Lo de incluir arctiodactyla es porque a menudo hay rastros de especies de este orden que no se pueden asignar con certeza a una especie, pero sí al grupo. Por ejemplo de jabalí/ciervo. Hay que ir al orden puesto que el suborden ya los subdivide en grupos distintos y tampoco encajarían en esta agrupación.
Artiodactyla indet.
https://observation.org/soort/info/974782
Ya existía en Observation.org. La he agregado a la lista de especies de España.
Carnivora indet. ya está agregado en la lista de especies de España
Alectoris rufa / Perdix perdix
https://spain.observation.org/soort/view/1003732
Añadida a Observation.org y a la lista local de aves de España
Salud!
HECHO
#58
Información General sobre Observation.org / Re:Especies que faltan
Último mensaje por Maeradefigar - Noviembre 26, 2020, 11:20:54 PMHola,
Sería interesante que se pudiesen ingresar también desde Obsmapp, además desde la web.
Un saludo.
Sería interesante que se pudiesen ingresar también desde Obsmapp, además desde la web.
Un saludo.
Cita de: Coordinación Observado.es en Noviembre 21, 2020, 07:35:47 PMCita de: Maeradefigar en Noviembre 20, 2020, 01:49:08 PM
Hola.
Carnivora sale en la web, no así en la app, le ocurre lo mismo que ocurría con el Quercus orocantabrica
Lo de incluir arctiodactyla es porque a menudo hay rastros de especies de este orden que no se pueden asignar con certeza a una especie, pero sí al grupo. Por ejemplo de jabalí/ciervo. Hay que ir al orden puesto que el suborden ya los subdivide en grupos distintos y tampoco encajarían en esta agrupación.
Artiodactyla indet.
https://observation.org/soort/info/974782
Ya existía en Observation.org. La he agregado a la lista de especies de España.
Carnivora indet. ya está agregado en la lista de especies de España
Alectoris rufa / Perdix perdix
https://spain.observation.org/soort/view/1003732
Añadida a Observation.org y a la lista local de aves de España
Salud!
#59
Información General sobre Observation.org / Re:Especies que faltan
Último mensaje por Coordinación Observation España - Noviembre 25, 2020, 08:51:51 AMCita de: ja_sarrion en Noviembre 24, 2020, 06:43:02 PM
Para añadir esta especie que se encuentra en la ciudad autónoma de melilla
Artrópodos (Otras familias))
Scorpio maurus
Escorpión dorado de israel
Linnaeus, 1758
Scorpionidae
https://www.gbif.org/species/6894666
HECHO
#60
Información General sobre Observation.org / Re:Especies que faltan
Último mensaje por ja_sarrion - Noviembre 24, 2020, 06:43:02 PMPara añadir esta especie que se encuentra en la ciudad autónoma de melilla
Artrópodos (Otras familias))
Scorpio maurus
Escorpión dorado de israel
Linnaeus, 1758
Scorpionidae
https://www.gbif.org/species/6894666
Artrópodos (Otras familias))
Scorpio maurus
Escorpión dorado de israel
Linnaeus, 1758
Scorpionidae
https://www.gbif.org/species/6894666